Strukturę organizacyjną określa Regulamin Organizacyjny KZGM w Katowicach. Organizacja wewnętrzna KZGM wynika z podziału zadań, zakresu działania komórek organizacyjnych oraz indywidualnych zakresów czynności pracowników.
W KZGM działają następujące komórki organizacyjne i samodzielne stanowiska pracy, oznaczone symbolami i przedstawione graficznie w schemacie organizacyjnym, stanowiącym załącznik nr 1 do Regulaminu Organizacyjnego KZGM:
- Dyrektor - DN:
- Audytor Wewnętrzny - NAW
- Pełnomocnik Dyrektora ds. Systemu Jakości - NSJ
- Dział Prawny - NO
- Zespół Radców Prawnych - NRP
- Dział Organizacyjno-Kontrolny - NK
- Dział Kadrowo-Płacowy - NKP
- Inspektor Ochrony Danych - ND
- Specjalista ds. Obrony Cywilnej - NC
- Specjalista ds. BHP - NH
- Dział Zamówień Publicznych - NZ
- Dział Informatyki - NI
- Rzecznik Prasowy - NRZ
- Zastępca Dyrektora ds. Technicznych - DT:
- Zastępca Dyrektora ds. Eksploatacyjnych - DE:
- Główny Księgowy - GKF:
